Начисление НДФЛ по ставке 15%: правомерно ли налоговая складывает разные налоговые базы по всем компаниям?

У нас директору пришло уведомление от ИФНС по доплате НДФЛ.  Он у нас работает в двух компаниях , и везде получает и зарплату, и дивиденды. Мы считаем весь НДФЛ отдельно по двум компаниям , но и еще раздельно по дивидендам и зарплате.  Сейчас просчитала весь доход и весь налог директора и поняла , как считает налоговая . Она складывает весь доход - и зарплату и Дивиденды по всем компаниям!!! Не разделяет по дивидендам и по зарплате. А для нас, ведь это раздельные доходы и суммировать их нельзя!!!! На сколько правомерно такое начисление ИФНС? Имеют ли они на это право? Как  теперь поступить с этим уведомлением? Должен ли директор уплатить всю сумму или только столько , сколько нужно при сложении дивидендов с двух компаний? Отбросив доход по зарплате? Как правильно поступить налогоплательщику в этой ситуации?  Спасибо